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25.PCR扩增不出就引物有问题吗?

答:基本不是。当今发展出各色各样的PCR扩增技术,各色各样的高温聚合酶,就是来解决PCR扩增中遇到的扩不出、扩增效率低的问题。如巢式PCR就是扩增那些拷贝数很低的基因片段。 有些重复片段的扩增, GC含量高的片段,pcr引物设计,非要采用特殊扩增手段才能扩增出了。

引物扩增不出,主要是下列两种情况比较常见:

(1) RT-PCR。请注意,很多基因通过常规RT -PCR方法是很难扩增出来的。 RT- PCR成功的关键在于RT的反应的RNA质量和目标基因在特定组织和细胞中含量。

(2)从基因组中扩增。一般情况下,荧光定量pcr,基因在基因组中都是单拷贝,温州pcr,基因组作为模板需要严格控制用量。基因组DNA过高,会影响反应体系中的Mg和pH





转录组测序

转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不相同的。转录组测序()是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,快速地获取某一物种特定qi官或组织在某一状态下的转录本。相对于传统芯片而言,无需预先设计探针,即可对物种的细胞类型的转录组进行检测,能够提供较的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的良好工具。







动物组织细胞基因组DNA提取

操作步骤

1. 取新鲜或冰冻动物组织块0.1g(0.5cm3),尽量剪碎。置于玻璃匀浆器中,加入1ml的细胞裂解缓冲液匀浆至不见组织块,转入1.5ml 离心管中,加入蛋白酶K

(500ug/ml)20μl,混匀。在65℃恒温水浴锅中水浴30min,也可转入37℃水浴12~24h,间歇振荡离心管数次。于台式离心机以12000 rpm离心5min,取上清液入另

一离心管中。

2.加2倍体积异,倒转混匀后,可以看见丝状物,用100ul 吸头挑出,凉干,用200ul TE 重新溶解。(可进行PCR反应等,需要进一步纯化的按下列步骤进行)

3.加等量的酚??振荡混匀,离心12000 rpm,5min。

4.取上层溶液至另一管,加入等体积的?,振荡混匀,离心12000 rpm,5min。

5. 取上层溶液至另一管,加入1/2体积的7.5mol/L氨加入2倍体积的无水乙醇,混匀后室温沉淀2min ,离心12000 rpm ,10min。

6.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,将附于管壁的残余液滴除掉。

7.用1ml 70%乙醇洗涤沉淀物1次,离心12000 rpm , 5min。

8.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,pcr检测,将附于管壁的残余液滴除掉,室温干燥。

9.加200ul TE重新溶解沉淀物,然后置于4℃或?C20℃保存备用。

10.吸取适量样品于GeneQuant上检测浓度和纯度。






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